如果自建房的二楼和一楼的窗户大小不一致，可能会对房屋的美观和功能产生一些影响。

首先，窗户的大小与外立面的统一性有关。如果一楼和二楼的窗户大小不同，可能会影响外立面的美观和协调性。特别是在住宅小区中，外立面的窗户统一性非常重要。

其次，窗户的大小也与房屋的功能有关。不同楼层的窗户大小不同，可能会影响不同楼层的采光、通风、视野等方面的功能。例如，如果一楼的窗户较小，可能会影响采光和通风，而二楼的窗户较大，可能会更好地满足卧室和小客厅的采光和视野需求。

因此，如果自建房的二楼和一楼的窗户大小不一致，可能会对房屋的美观和功能产生一些影响。在设计和建造时，需要根据实际情况和需求进行权衡和选择。